Der Prorektor war der Vorgänger des amtierenden Rektors. Er fungierte als Stelllvertreter des amtierenden Rektors und gehörte dem Konsistorium bzw. dem Akademischen Senat an, das/der den neuen Rektor wählte.
Diese Grundregel wurde in der Zeit des Nationalsozialismus nicht eingehalten: 1938/39–1939/40 fungierte Hans Hirsch als Prorektor und 1940/41–1942/43 Arthur Marchet, die jedoch anschließend nicht das Rektorat übernahmen. Der folgende Prorektor (1943/44–1944/45) Viktor Christian übernahm im April 1945 das Rektorat, übte dieses jedoch nur für wenige Tage aus - bereits am 10. April wurde das Universitätsviertel durch die Rote Armee besetzt.